ผลข้างเคียงของวัคซีนไข้ทรพิษ (Vaccinia) ปัญหาเล็กน้อยถึงปานกลาง  ผื่นเล็กน้อย อยู่ได้ 2-4 วัน อาการบวมและกดเจ็บของต่อมน้ำเหลือง นาน 2-4 สัปดาห์หลังตุ่มพองหาย มีไข้มากกว่า 100°F (ประมาณ 70% ของเด็ก, 17% ของผู้ใหญ่) หรือมากกว่า 102°F (ประมาณ 15%-20%  การฉีดวัคซีน ของเด็ก, ต่ำกว่า 2% ของผู้ใหญ่) ตุ่มทุติยภูมิที่อื่นในร่างกาย (ประมาณ 1 ต่อ 1,900)ปัญหาปานกลางถึงรุนแรง  การติดเชื้อที่ดวงตาอย่างรุนแรง หรือสูญเสียการมองเห็น เนื่องจากมีการแพร่กระจายของไวรัสวัคซีนไปที่ดวงตา ผื่นทั้งตัว (มากถึง 1 ต่อ 4,000) ผื่นรุนแรงกับผู้ที่เป็นโรคเรื้อนกวาง (มากถึง 1 ต่อ 26,000)